Mendía inició su formación en la prestigiosa academia Tahuichi Aguilera en Santa Cruz hasta los 4 años. Posteriormente, emigró a España, donde continuó su desarrollo futbolístico en equipos como CF Damm, Alzamora, Turó de la Peira y Montañesa, fortaleciendo su técnica y visión de juego.

A los 23 años, tuvo un paso por Libertad Gran Mamoré, donde fue convocado a dos partidos en la Primera División boliviana, aunque no llegó a debutar oficialmente. Luego, en 2024, defendió los colores de Alianza Beni durante medio año, mostrando su calidad y entrega en el campo.

Actualmente, Fabián forma parte del club italiano Supergiovane Castelbuono, donde comparte equipo con Mark Patrick Rodríguez Cabrera, convocado a la Sub-20 de Bolivia. Hasta la fecha, Mendía ha disputado 14 partidos, 13 de ellos como titular, anotando un gol y registrando dos asistencias desde su posición de lateral izquierdo.

El desempeño de Fabián Mendía en Italia no solo refleja su crecimiento profesional, sino que también lo convierte en un ejemplo a seguir para los jóvenes talentos deportivos del Beni que sueñan con trascender fronteras a través del fútbol.